PhD-Stelle – Bioinformatik - Berlin

PhD-Stelle – Bioinformatik / RNA-Biologie (d/w/m) · Entgeltgruppe · Unternehmensbeschreibung · Das Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) widmet sich der biomedizinischen Translation. Seine Mission ist es, Forschungsergebnisse in personalisierte Prävention, Diagnostik ...

Jobbeschreibung

PhD-Stelle – Bioinformatik / RNA-Biologie (d/w/m)

Entgeltgruppe

Unternehmensbeschreibung

Das Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) widmet sich der biomedizinischen Translation. Seine Mission ist es, Forschungsergebnisse in personalisierte Prävention, Diagnostik und Therapie zu übertragen, um Patient*innen zu helfen und der Wissenschaft hierfür wirkungsvolle Werkzeuge bereitzustellen. Mit rund 750 Mitarbeitenden fokussiert das BIH auf translationale Methodenentwicklung, Präzisionsmedizin, regenerative Therapien und biomedizinische Datenwissenschaften. In enger Einbindung in die Charité ermöglichen exzellente Forschung sowie Plattformen und Programme einen beschleunigten Transfer in die klinische Anwendung. Das BIH formt dabei starke Partnerschaften und fördert innovationsorientierte Medizin national und international.

Die AG Beule am Berlin Institute of Health an der Charité – Universitätsmedizin Berlin (BIH) sucht zum befristet bis zum eine*n hochmotivierte Doktorand*in (w/m/d) in Vollzeit (38,5 h/Woche) zur Untersuchung der Rolle nicht-kodierender RNAs und der transkriptionellen Regulation innerhalb der hypothalamisch-hypophysären endokrinen Achse des Gehirns.

Das Promotionsvorhaben erfolgt unter der Betreuung von Dr. Andranik Ivanov und umfasst eine enge Zusammenarbeit mit internationalen experimentellen Forschungspartnern.

Das erwartet Sie

Projektbeschreibung
Ziel dieses Promotionsprojekts ist es, transkriptionelle und post-transkriptionelle Regulationsmechanismen in neuroendokrinen Systemen aufzuklären, mit besonderem Fokus auf nicht-kodierende RNAs. Das Projekt verbindet die Entwicklung und Anwendung computergestützter Methoden mit der Analyse und Integration großskaliger, hochdimensionaler biologischer Datensätze aus Gehirngeweben.

Die/der Kandidat*in arbeitet mit komplexen Datensätzen, die mehrere biologische und technische Kovariaten enthalten, und trägt zur Rekonstruktion RNA-vermittelter regulatorischer Netzwerke bei. Das Projekt umfasst integrative Multi-Omics-Analysen, fortgeschrittene statistische Modellierung sowie den gezielten Einsatz von Machine-Learning-Methoden, sofern diese biologisch sinnvoll sind. Die enge Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern gewährleistet eine starke biologische Verankerung und hypothesengeleitete Datenanalyse.

Das bringen Sie mit

Unbedingt erforderlich:

• Abgeschlossenes oder bis zum Startdatum abgeschlossenes Masterstudium in Bioinformatik, Biologie, Informatik oder einem verwandten Fach
• Starkes Interesse und nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Omics-Daten
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Python oder R sowie Bash
• Sicherer und routinierter Umgang mit Linux-basierten Rechenumgebungen
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Wünschenswert:

• Erfahrung mit großskaligen biologischen Datensätzen (z. B. Transkriptomik, Small-RNA-Daten, Proteomik oder verwandte Daten)
• Erfahrung mit multi-parametrischen bzw. multi-kovariaten statistischen Modellen
• Vertrautheit mit CLIP-seq-basierten Methoden (z. B. miR-eCLIP)
• Hintergrund oder starkes Interesse an Neurowissenschaften oder RNA-Biologie

Das bieten wir Ihnen

• Eine voll finanzierte Promotionsstelle über 3 Jahre in einem kooperativen und anregenden Forschungsumfeld
• Integration in die Core Unit Bioinformatics, eine große, internationale und interdisziplinäre Gruppe aus Bioinformatikerinnen, Softwareentwicklerinnen, Physikerinnen, Statistikerinnen und Lebenswissenschaftler*innen
• Eine freundliche, offene und kollaborative Arbeitsatmosphäre mit starkem kollegialem Austausch
• Einen Arbeitsplatz im Zentrum Berlins mit exzellenter Infrastruktur und enger Anbindung an experimentelle Forschungsgruppen
• Zugang zu modernsten Rechenressourcen und hochwertigen Multi-Omics-Datensätzen
• Möglichkeiten zum Aufbau fundierter Expertise in RNA-Biologie, transkriptioneller und post-transkriptioneller Regulation sowie fortgeschrittener Bioinformatik
• Teilnahme an strukturierten Promotions- und Weiterbildungsprogrammen im Rahmen von BIH und Charité
• Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. Das Jahresgehalt (brutto) ist für eine Vollzeitstelle ohne Sonder- oder Zusatzzahlungen angegeben. Den Tarifvertrag finden Sie hier.
• Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
• Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
• 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
• Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
• Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Mobiles Bürgeramt vor Ort
• Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad
• Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin

Wir leben Vielfalt

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.
Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.

Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über unser Online-Bewerbungsformular mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weitere relevante Anlagen (wie Arbeitgeberzeugnisse, Abschlusszeugnisse etc.) unter der ID 6552 bis zum ein.

Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden Sie hier .

Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.

Nähere Informationen zum BIH finden Sie hier .

Bewerbung

An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.

Jetzt unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.