Masterarbeit oder Praktikum zum Thema: Optimierung der Produktion proteinbasierter Biosensoren - Jülich, Deutschland - Forschungszentrum Jülich

Beschreibung

Die Kontamination von Lebensmitteln mit Schimmelpilzen oder Pestiziden kann schwerwiegende gesundheitliche Auswirkungen haben. Maßgeschneiderte bifunktionelle Proteinen können in einfachen und kostengünstigen Sensoren zum Nachweis solcher Kontaminationen eingesetzt werden und so die Sicherheit von Lebensmitteln verbessern. Die Optimierung der Produktion solcher Proteine steht im Fokus dieses Projekts. Es ist im Verbundprojekt Bioökonomie-Revier angesiedelt, welches den Strukturwandel im Rheinischen Braunkohlerevier vorantreiben und einen Beitrag zur Transition zu einer nachhaltigen Gesellschaft und Wirtschaftsweise leisten möchte. Mehr Informationen zum Projekt finden Sie unter:

Ihre Aufgaben:

Bei der ausgeschriebenen Stelle wird der Schwerpunkt auf der Optimierung der mikrobiellen Produktion bifunktioneller Proteine liegen, die in Biosensoren zur Detektion eingesetzt werden sollen. Bifunktionelle Proteine sind eine innovative Technologieplattform, die durch Verknüpfung von Adhäsionsvermittlerpeptiden mit funktionellen Einheiten zielgerichtete Applikationen ermöglicht. Durch die Sekretion dieser Proteine durch den Plattformorganismus Corynebacterium glutamicum kann deren biotechnologische Herstellung wesentlich vereinfacht werden.

In diesem Projekt soll deshalb zunächst eine Stammbibliothek mit verschiedenen Sekretions-Signalpeptiden erstellt werden. Anschließend werden mit Hilfe automatisierter Methoden die besten Stämme ausgewählt und weitere Einflussfaktoren auf die Sekretion untersucht. Das Ziel wird dabei sein, einen optimierten Produktionsprozess für ein BiFuProt im 1-Liter-Bioreaktor zu etablieren.

Zu Ihren Aufgaben im Rahmen des Projektes wird gehören:

• Molekularbiologische Erstellung einer C. glutamicum Sekretionsstammbibliothek mit Hilfe eines OpenTrons OT-2 Laborroboters.
• Kultivierung und Screening der Stämme auf einer automatisierten Mikrokultivierungsplattform.
• Bioprozessoptimierung ausgewählter Stämme im Mikroliter- und Labormaßstab.
• Optimierung des zur Quantifizierung der bifunktionellen Proteine genutzten splitGFP-Assays und Kooperation mit LC-MS/MS Proteinanalytik.
• Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten.
• Selbstständige Auswertung und Präsentation der Ergebnisse der eigenen Arbeit.

Ihr Profil:

• Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Molekularbiologie oder eine verwandte Disziplin.
• Sie konnten bereits Erfahrungen bei der Arbeit im Labor sammeln, z.B. bei Praktika oder Abschlussarbeit.
• Sie sind interessiert am Einsatz von Hochdurchsatz-Methoden im Labor und an der Optimierung biotechnologischer Prozesse.
• Sie sind bereit, sich in neue Methoden (z.B. Klonierung, Proteinaufreinigung, Kultivierung) und grundlegende Programmierung (Python) einzuarbeiten und/oder bringen bereits Vorkenntnisse in diesen Bereichen mit.
• Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit.
• Sie zeigen eine sehr zuverlässige, strukturierte und ordentliche Arbeitsweise.

Unser Angebot:

Unser Institutsbereich Biotechnologie (IBG-1) am Institut für Bio- und Geowissenschaften ist führend für Bioprozessentwicklung im Bereich Industrielle Biotechnologie. Die Arbeitsgruppe Bioprozesse und Bioanalytik hat große Kompetenzen in der Bioprozessoptimierung und setzt dabei modernste Technik zur Automatisierung und Digitalisierung von Laborarbeiten ein. Hier wird an innovativen Ansätzen zur zielgerichteten Durchmusterung von Stammbibliotheken und zur Entwicklung biotechnologischer Prozesse geforscht.

Wir arbeiten an hochaktuellen, innovativen Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten Wir bieten Ihnen:

• Ein interessantes und gesellschaftlich relevantes Thema für ihre Abschlussarbeit mit zukunftsorientierter Themenstellung
• Eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung und die neuste Technologie
• Qualifizierte und gewissenhafte Betreuung durch wissenschaftliche Kolleg:innen
• Interdisziplinäre Zusammenarbeit in einem engagierten und kollegialen Team
• Eigenverantwortliche Vorbereitung und Durchführung der übertragenen Aufgaben
• Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. tlw. im Homeoffice

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr:

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.